1878年托木斯克帝国大学成立时，在众多院系中，曾计划开设历史语言系，但这一计划直到1917年7月1日（14日）才得以实施。该系拥有古典文学斯拉夫-俄罗斯、历史和罗马-日耳曼语系。 1920年与法学院并入社会科学学院，1922年关闭。 1940年，历史学院重新开放。从 1941 年到 1974 年，它作为历史和语言学存在。自1974年以来，历史学院成为州立大学的一个独立机构。如果说早年历史系只有两个教研室（俄语和通史），那么现在学院有九个教研室，75%的教师拥有职称和学位。 2018年，由于加入了政治学系（此前该系一直在哲学系内运作），历史系转变为历史与政治科学系。

四年的学习，毕业生将获得更高的专业教育并获得学士学位，随后的两年学习将获得硕士学位。