托木斯克国立大学具有选择繁多的研究生专业。以下为大家具体列举：
数学、实用数学与信息学、力学与数学建模、基础信息学与信息技术、物理学、无线电物理、化学、地质学、水文气象学、生态与自然资源利用、生态学、土壤学、信息系统与技术、实用信息学、软件工程、光学工程、光子学与光子信息学、应用力学与机械学、机电一体化与机器人、物理科技、品质管理、创新技术、森林学、农业学、景观建筑、心理学、经济学、管理学、人力资源管理、国家与市政管理、金融与信贷、社会学、社会工程、青年活动组织学、法学、外国区域研究、俄罗斯区域研究、俄罗斯区域研究（西伯利亚现代文化、发展与历史）、政治学、国际关系、广告学与公共关系、新闻学、出版专业、俄语语言文学、语言学、历史、档案学与档案管理、人类学与民族学、哲学、体育文化、文化学、图书馆学与文化遗产保护、设计专业。
目前开设全英文授课的研究生专业有：数学（数学分析与建模基础上的教学课程）、实用数学与信息学（数据智能分析与图书信息学）、物理学（生物医学中采用的物理方法与信息技术）、化学（化学基础课程）、信息系统与技术、实用信息学、心理学、经济学、管理学、管理学（经济管理）、金融与信贷、国际关系（欧盟研究）、语言学（专业领域翻译基础教程）。
其中，值得强调的是，托木斯克国立大学已经有4个专业具有国际认证：《数字人文》、《欧盟研究》、《机构财务与会计》和《健康与安全心理学》。这些专业都已经通过了FIBBA的专业认证。
《数字人文》专业的研究生具有独特性—在专业技术和人文合作领域工作的专家，该专业已经成功地获得了国际认证。这就为该项目的毕业生开拓了在国外工作的机会：作为机器人设计师、移动应用软件和电脑游戏设计师、社交网络和网络教育领域的分析师。托国立的这个研究生项目通过了最长期限的认证：到2022年，满足了52个质量要求并且有9项超出要求。因此，专家指出，托国立研究生课程有着合乎要求的定位，将在俄罗斯市场上和与潜在的竞争对手的合作关系上具有明显的优势。
历史系的《欧盟研究》专业于2016年通过了FIBBA的专业认证，成为了具有国际品质的研究生项目。学生将主要研究欧盟的形成历史、发展趋势，欧盟对世界政治局势的影响等，毕业生们将成为科研所、大学、专业研究机构的主要人选。该专业同时也采取全英文授课。
《机构财务与会计》—托木斯克国立大学已经与国际注册会计师协会签署协议，加入了ACCA Accelerate项目，从而使学生们－金融专业在更短的时间内获得专业资格。托木斯克国立大学是俄罗斯六所金融专业具有ACCA国际认证的高校之一。托木斯克国立大学的学生，只要是攻读经过ACCA认证的《机构内的财务与会计》专业研究生项目的，都可以在学习过程中通过14门考试中的9门，并且获得相应的认证。得益于新签订的协议，这个专业的学生在学习结束前都可以注册成为ACCA的学生，特殊情况除外。他们将免费获得Fundamentals条件下的9门考试并且在校期间可以参加这9门的专业考试。除此之外，托木斯克国立大学的学生还将获得ACCA网上资源的入口，包括在MyACCA－门户网站上创立个人账号，这是作为学习期间的额外培训。
《健康与安全心理学》研究生项目于2011年开设，人才市场对该项目的毕业生们有着很大的需求量：他们在不同的企业工作，能够在冲突情况下完成复杂的任务、能够解决问题并且实施重建、在心理学、信息和人员安全领域为个人提供专业的心理支持。
除了以上4个获得国际认证资格的专业，在2016年，托木斯克国立大学国际实验室TSSW（横跨西伯利亚科研之路）的支持下还开设了《西伯利亚：资源和区域发展的现代化实践》（俄罗斯研究：西伯利亚）项目，项目定位于外国学生和专家，该国际项目将由俄罗斯和其区域的专家参与完成。该研究生项目将在SAE框架内实施：《TSSW:西伯利亚未来学院》。
它的创建者强调说，这个研究生项目的出现与国际和跨界合作的积极发展息息相关。为了国际项目的成功开展必须要知道区域的具体情况，经济发展的特点、社会和文化生活和管理领域的知识。
在研究生期间学生将会加深对商务俄语、经济、现代政治、历史和西伯利亚文化等的了解。他们将研究独一无二的区域特点并且在项目活动中获得很多经验。
关于毕业，每一个项目参加者都应该准备自己的项目，比如，在西伯利亚建立娱乐商业或者区域和地区的品牌。值得强调的是，这些项目将在合作伙伴的项目基础上实施：在西伯利亚的非政府组织、中小型企业、公共机构和自我管理的地方政府代表企业。尽管该项目定位于外国学生，但是将会用俄语进行教学。现在已经收到了来自东南亚和中亚国家学生的申请。值得强调的是，白俄罗斯、吉尔吉斯斯坦、哈萨克斯坦和塔吉克斯坦的公民在国家间协议框架内具有获得免费就读名额的权利。
需要注意的是，托木斯克国立大学的研究生专业学制为两年。
有关我校所有硕士专业您可点击此链接查看，在页面内表格的最后一列您也能看到面向外国留学生的学费。